伊斯坦布尔考古博物馆紧邻托普卡帕宫的第一庭院，馆内收藏包括了由安纳托利亚各地遗迹出土的古希腊和古罗马时代的雕刻、绘画等古代艺术经典作品，其中尤以在腓尼基皇家墓园中发现的大批石棺最引人瞩目。

该博物馆原是皇宫的外花园，在宫殿建筑基础上改造而成。如今分为三个部分——考古博物馆（主楼）、古代东方博物馆、伊斯兰艺术博物馆（Tiled Kiosk）。从老皇宫的大门有一条不起眼的小巷通向博物馆，有时容易错过。

主楼中的三大镇馆之宝

1. 塔伯尼特石棺（Tabnit Sarcophagus）
这是一位埃及大将军的石棺，采用黑色的闪长岩做成人体的形像，可上溯到公元前六世纪。起胸前刻有象形文字，上头还刻了咒语。石棺出土时完好无缺，葬在其内的木乃伊也没有被盗走，和石棺同时陈列在考古博物馆中。

2. 哀伤女子石棺（Sarcophagus of Mourning Women）
这具石棺上雕刻着十八名表情哀伤、姿态各异的女子，分别站在一座希腊爱奥尼亚式神殿的柱子间。她们为何哀伤、为谁哀伤并无从得知，但却丝毫不影响石棺的艺术价值，反而突显一种悲剧之美。

3. 亚历山大大帝石棺（Alexander Sarcophagus）
这是一座大理石石棺，上面的雕刻描绘了亚历山大大帝大败波斯的战争场面，由于雕刻极其精湛出众，以至于挖掘之初人们甚至怀疑它就是亚历山大大帝的棺椁，但在科学上尚不能证实这具石棺的主人。

古代东方博物馆
这里的东方其实是相对欧洲而言，指中东地区灿若星河的古代文明。馆内陈列着埃及、巴比伦、亚述、赫梯等中东地区古国的文物，包括许多距今三四千年前的古物。在这里可以看到巴比伦城伊什塔尔门的釉砖浮雕，不容错过。

伊斯兰艺术博物馆
曾作为土耳其和伊斯兰艺术博物馆对公众开放，后来并入伊斯坦布尔考古博物馆中。馆内陈列的瓷器包括土耳其苏丹们的收藏，极具艺术价值。